ยูโรปาลีกมีระบบการแข่งขันรอบคัดเลือกเหมือนกับรายการแชมเปียนส์ลีก โดยมีรอบเพลย์ออฟ (Play-off round) เป็นรอบคัดเลือกสุดท้าย ใช้ระบบแข่งแบบเหย้า-เยือน 2 นัด เพื่อหาทีมเข้าสู่รอบแบ่งกลุ่ม แต่ยูโรปาลีกมีจำนวนทีมแตกต่างจากแชมเปียนส์ลีก โดยปีนี้ซึ่งเป็นฤดูกาล 2019–20 มีสโมสรเข้ารอบเพลย์ออฟทั้งหมด 42 ทีม
แบ่งการแข่งขันเป็น 2 สาย
จำนวน 42 ทีมดังกล่าว แบ่งเป็น 2 สาย คือสายแชมป์ (Champions Path) ของประเทศต่างๆ และสายที่ไม่ได้เป็นแชมป์ (Main Path) โดยสายแรกมี 16 ทีม ผ่านเข้ามาจากรอบคัดเลือกรอบสาม 10 ทีม และอีก 6 ทีมมาจากการตกรอบคัดเลือกรอบสามของแชมเปียนส์ลีก ส่วนสายที่ไม่ได้เป็นแชมป์มี 26 ทีม ผ่านเข้ามาจากรอบคัดเลือกรอบสามในสายเดียวกันทั้งหมด
การจัดการแข่งขันของสายแชมป์เริ่มจากการกำหนดทีมวางคือ 6 ทีมจากแชมเปียนส์ลีก จากนั้นก็จับสลากแบ่งเป็น 2 กลุ่ม มีทีมวางกลุ่มละ 3 ทีม ร่วมกับทีมที่ไม่ได้เป็นทีมวาง 5 ทีม ตามด้วยการจับสลากประกบคู่ระหว่างทีมวางกับทีมที่ไม่ได้เป็นทีมวาง โดยอีก 2 ทีมที่ไม่ได้เป็นทีมวางต้องแข่งกันเอง จากนั้นก็ได้ทำการแข่งขันเมื่อเดือนสิงหาคมปีที่แล้ว
ส่วนกลุ่มสายหลัก หรือสายที่ไม่ได้เป็นแชมป์ ดำเนินการเหมือนกับสายแชมป์ แต่แบ่งเป็น 3 กลุ่ม โดย 2 กลุ่มแรกมีกลุ่มละ 8 ทีม ขณะที่กลุ่ม 3 มี 10 ทีม แต่ละกลุ่มมีทีมวางซึ่งทางยูฟ่าคัดเลือกจากผลงานกลุ่มละครึ่ง และได้ทำการแข่งขันไปเมื่อเดือนสิงหาคมปีที่แล้วเช่นเดียวกับสายแชมป์
ทีมที่ผ่านเข้าสู่รอบแบ่งกลุ่ม
สำหรับทีมผ่านจากรอบเพลย์ออฟเข้าสู่รอบแบ่งกลุ่มในฤดูกาลนี้ เฉพาะสายแชมป์ 8 ทีม ประกอบด้วย เฟเรนส์วาโรช (ฮังการี) โคเปนเฮเกน (เดนมาร์ก) เซลติก (สกอตแลนด์) เอฟ91 ดูเดแลงก์ (ลักเซมเบิร์ก) ลูโดโกเรตส์ รัซกราด (บัลแกเรีย) คาราบัก (อาเซอร์ไบจาน) อัสตานา (คาซัคสถาน) และ สโลวาน บราติสลาวา (สโลวาเกีย)